Jú svartari náttin, tess bjartari glottin
- Ludvík á Brekku
Onnur tíðindi

Granskingarráðið: Týsdagin 29. januar vardi Annika Jacobsen ph.d. ritgerð sína í bioinformatik, ið kallast “Reasoning about cell dynamics using network models” við Vrije Universiteit Amsterdam.

Í ritgerðini verða molekylerar orsøkir til kompleksar sjúkur, eitt nú krabbamein, granskaðar við at nýta teldumodell. Tey ymsu teldumodellini vóru bygd á ymsar fortreytir, t.d. nágreiniligari vitan ella heilt lítla vitan um tær molekylæru interaktióninar. Við lítlari vitan varð antin big data nýtt til at fáa meira innlit ella vóru allar møguligu kombinatiónir kannaðar.

Høvuðsvegleiðari var Jaap Heringa, dr. professari, og K. Anton Feenstra, dr. var hjávegleiðari. Báðir starvast á The Centre for Integrative Bioinformatics (IBIVU), Department for Computer Science, Faculty of Science,  Vrije Universiteit Amsterdam.

Í metingarnevndini vóru:

- Ioannis Xenarios, dr. professari, Centre for Integrative Genomics, Faculty of Biology and Medicine,  University of Lausanne, Sveis.
- Paulien Hogeweg, dr. professari, Theoretical Biology and Bioinformatics Group, Faculty of Science, Utrecht University, Holland.
- Lodewyk Wessels, dr. professari, Division of Molecular Carcinogenesis, Oncode Institute, The Netherlands Cancer Institute, Holland.
- Martine J. Smit, dr. professari, Amsterdam Institute for Molecules, Medicines and Systems (AIMMS), Division of Medicinal Chemistry, Faculty of Sciences, Vrije Universiteit Amsterdam, Holland.
- Sanne Abeln, dr., Centre for Integrative Bioinformatics (IBIVU), Department of Computer Science, Faculty of Science, Vrije Universiteit Amsterdam, Holland.

Verjan var almenn, og nógvir áhoyrarar vóru til staðar, harímillum familja, vinir og starvsfelagar.

Sum siðvenja er í Hollandi vóru mannagongdin, málberingin og klæðini hátíðarlig. Verjan vardi í ein tíma, 10 minuttir við framløgu og 50 minuttir, har metingarnevndin settu spurningar.

Limirnir í metingarnevndini høvdu lisið ritgerðina við stórum áhuga og bóru nógv rósandi orð m.a. at granskingin var væl úr hondum greidd við fleiri samstørvum, tvørfakligum serkunnleika (lívfrøði og teldufrøði) og at tað var áhugavert, at ymsir hættir at modellera lívfrøðiligar skipanir vóru nýttir.

Ritgerðin er sett saman av 5 vísindaligum greinum:

1. Construction and Experimental Validation of a Petri Net Model of Wnt/β-catenin Signaling. PLoS One. 2016, 11(5), e0155743. doi: 1371/journal.pone.0155743

2. Aurora kinase A (AURKA) interaction with Wnt and Ras-MAPK signalling pathways in colorectal cancer. Rep. 2018, 8(7522). doi: 10.1038/s41598-018-24982-z

3. The ability of transcription factors to differentially regulate gene expression is a crucial component of the mechanism underlying inversion, a frequently observed genetic interaction pattern. 2018. doi: 10.1101/449520

4. A framework for exhaustive modelling of genetic interaction patterns using Petri nets. Verður ummæld í løtuni.

5. BioASF: A Framework for Automatically Generating Executable Pathway Models Specified in BioPAX. Bioinformatics. 2016, 32(12), i60-i69. doi: 1093/bioinformatics/btw250

Um tú veitst okkurt, sum VP ikki veit - skriva so til vp@vp.fo